Para mí lo que es raro es que las dos hembras se toleren y no se hayan peleado ya.
Yo veo un inconveniente. Si las dos ponen en el mismo nido, seguro que no terminan la puesta las dos a la vez. Entonces habrá distintas fechas de nacimiento para los pollitos, lo que será un problema, ya que se levantarán cuando salgan los primeros pollitos y el resto de los huevos o morirán o te tendrás que buscar alguna gallina o incubadora.
Si ya están poniendo las dos seguro que habrá dos tipos de huevos con distinta forma, coloración, tamaño, aparte de las pequeñas diferencias que haya entre los huevos de una misma perdiz.